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代谢组学

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蛋白质组学数据分析

蛋白质组学数据分析

统计学分析
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统计学分析(1)基本原理统计质谱谱图原始数据经数据库检索后获得的鉴定和定量信息,通过对定量信息的分析处理筛选不同样品间表现出显著定量差异的蛋白。 (2)技术路线  (3)结果示例质量偏差统计展示质谱检测中各肽段鉴定的质量偏差(ppm)   酶切效率展示质谱鉴定结果中各肽段的长度及漏切位点分布   定量数据重复性展示各样品中蛋白定量的相关性与重复性   差异蛋白筛选基于不同筛选标准,筛选样品间定量差
生物信息学分析
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生物信息学分析(1)基本原理基于蛋白定量数据,及GO、KEGG、COG、STRING等数据库信息,对差异蛋白进行聚类、注释与富集以及蛋白互作网络分析。 (2)技术路线    (3)结果示例聚类分析展示差异蛋白聚类热图及各类别蛋白定量趋势。  GO注释与富集分析展示基于生物学过程(BiologicalProcess,BP),细胞组成(CellularComponent,CC)和分子功能(Molecu
基于定量蛋白质组学的互作分析
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(1)背景介绍  蛋白相互作用一直是研究蛋白功能和机理的重要内容。近年来,蛋白相互作用组学越来越成为研究者们关注的热点。而亲和纯化串联质谱分析(AP-MS)是目前使用最多、最重要的蛋白相互作用研究方法。  传统的基于蛋白定性鉴定的AP-MS方法难以区分与目的蛋白特异性结合的相互作用蛋白和非特异性结合的背景蛋白。近年来,随着质谱仪器性能及非标记定量策略的发展,各种非标记定量策略被应用到AP-MS实验
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